网络病毒防御专家
网络病毒防御专家
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病毒溯源工程师
个人总结
5年病原微生物基因组学与分子流行病学研究经验，专注病毒进化与传播链溯源。熟练运用高通量测序、系统发育分析与贝叶斯进化推断，主导完成4项病毒溯源课题，累计解析超1.2万份样本。具备从实验设计到报告输出的全流程能力，能支撑公共卫生与生物安全场景的快速决策。
工作经历
广东省疾病预防控制中心
广州
公共卫生疾控机构
病毒溯源工程师
2021年7月 - 至今
病毒基因组测序分子溯源
- 主导呼吸道病毒测序与溯源分析，累计解析样本逾8000份，支撑3起聚集性疫情传播链判定，平均溯源周期缩短30%。
- 搭建自动化生信分析流程，实现从原始测序数据到进化树报告的一键输出，单批次分析耗时由8小时降至2.5小时。
- 参与建立省内病毒基因组变异监测数据库，累计入库序列1.2万条，为变异株风险评估提供数据支撑。
广州达安基因股份有限公司
广州
IVD上市公司
生物信息分析工程师
2019年7月 - 2021年6月
NGS数据分析变异检测
- 负责病原微生物NGS数据分析，开发变异检测脚本，将变异识别准确率提升至99.2%，支撑6项检测产品研发。
- 优化数据处理流程，单样本分析时间从4小时压缩至1.5小时，月均处理样本量提升2倍，保障交付周期。
项目经验
新冠变异株传播链溯源与进化分析
2022年1月 - 2022年12月
技术负责人
- 整合流行病学调查与全基因组序列，采用BEAST贝叶斯推断重建传播网络，锁定关键传播节点，溯源结论被省指挥部采纳。
- 构建自动化可视化报告模板，将分析结果输出时间从3天压缩至6小时，累计支撑20余次专题研判。
病原微生物宏基因组溯源分析平台
2020年3月 - 2021年5月
核心开发
- 基于Nextflow搭建mNGS分析流程，实现从原始reads到物种鉴定与进化分析的全自动处理，覆盖30余种病原体。
- 平台上线后单样本分析成本降低约25%，支撑公司6项检测产品注册申报。
研究经历
呼吸道病毒跨种传播与分子适应机制研究/研究骨干
广州
病原微生物研究所
2019年9月 - 2021年6月
- 基于公共数据库与自建样本构建系统发育树，鉴定了3个关键受体结合位点适应性突变，为跨种传播风险评估提供依据。
- 研究成果发表于核心期刊2篇，累计被引15次，支撑后续监测方案优化。
病毒基因组进化速率与时空扩散建模/研究助理
广州
公共卫生学院
2017年9月 - 2019年5月
- 采用贝叶斯系统地理学方法重建病毒时空扩散路径，识别出2条主要传播支系，准确率经回顾性验证达88%。
- 相关模型代码开源，被课题组后续3项研究复用。
主要成就
溯源周期缩短30%
通过流程自动化与标准化分析，将聚集性疫情溯源平均周期从14天压缩至10天以内。
基因组数据库建设
主导建设1.2万条序列的省内病毒变异监测数据库，支撑变异株风险评估与预警。
分析效率大幅提升
搭建一键式生信流程，单批次分析耗时降低约70%，释放人力投入高价值研判工作。
科研成果产出
以第一/共同作者发表核心期刊论文3篇，参与申请发明专利1项。
证书与认证
生物信息分析工程师（中级） - 工业和信息化部教育与考试中心
2022年6月
证明生物信息数据处理与流程开发能力。
PMP项目管理专业人士资格认证 - PMI（美国项目管理协会）
2023年11月
证明跨部门项目统筹与交付管理能力。
熊帅帅
病毒溯源工程师
教育背景
中山大学
985双一流
病原生物学 硕士
广州2016年9月 - 2019年6月
研究方向为病毒分子进化；相关课程：分子流行病学、生物信息学、医学统计。
华南农业大学
双一流
生物技术 本科
广州2012年9月 - 2016年6月
相关课程：微生物学、遗传学、分子生物学。
技能
病毒基因组测序与分析
系统发育与贝叶斯进化推断（IQ-TREE/BEAST）
Python/R 数据处理与可视化
分子流行病学调查
NGS 生信流程搭建（Nextflow/Snakemake）
生物安全实验室管理（BSL-2）
荣誉奖项
广东省科技进步二等奖（病毒分子溯源方向）
中山大学研究生学业奖学金一等奖
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