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基因组学研究员

熊帅帅

基因组学研究员
phone138 0013 8000
city上海
gender男
job_status离职-随时到岗
intended_city上海
max_salary25-35K
教育背景
复旦大学
985双一流
遗传学 博士
上海2015年9月 - 2020年6月

研究方向:肿瘤基因组学与单细胞测序;以第一作者发表SCI论文1篇。

华中农业大学
211双一流
生物技术 本科
武汉2011年9月 - 2015年6月

相关课程:分子生物学、遗传学、生物信息学。

技能
WGS/WES变异分析
单细胞转录组分析
Python/R 生信编程
GATK/Samtools 流程
Seurat/Scanpy
Linux 与集群运维
荣誉奖项
国家奖学金
上海市优秀毕业生
志愿服务经历
基因科普志愿讲师
上海科普志愿者协会
上海2022年3月 - 2023年12月
  • 为社区中学生开展基因科普讲座6场,累计覆盖300余人次。
课外活动
复旦大学生命科学学院研究生会
研究生学术部/学术部部长
上海2017年9月 - 2019年6月
  • 组织跨课题组学术沙龙12期,促成3项校际合作课题。
个人总结

5年基因组学与生物信息研究经验,专注肿瘤基因组与单细胞测序数据分析,熟练使用WGS/WES/RNA-seq全流程分析工具。主导3项队列研究的数据产出,累计分析样本超2000例,支撑2篇SCI论文发表。具备从实验设计到生信解读的完整闭环能力。

工作经历
上海精准医学研究院
上海
科研机构精准医疗
基因组学研究员
2020年7月 - 至今
肿瘤基因组生信流程
  • 负责肿瘤队列WGS/WES全流程分析,累计处理样本1200例,变异检出准确率提升至98%。
  • 搭建自动化生信分析流程,单样本分析周期由3天缩短至8小时,支撑团队年产出论文4篇。
  • 主导单细胞转录组数据解读,识别2个潜在治疗靶点,推动1项临床合作项目立项。
上海基源生物科技有限公司
上海
基因检测生物科技
生物信息分析工程师
2019年7月 - 2020年6月
RNA-seq数据质控
  • 参与RNA-seq差异表达分析项目,完成800例样本数据处理,交付报告准时率100%。
  • 优化数据质控标准,将低质量样本返工率由15%降至5%,节省实验成本约20万元。
研究经历
肿瘤微环境单细胞转录组研究/博士研究助理
上海
遗传学系
2016年9月 - 2020年6月
  • 构建肿瘤单细胞图谱,鉴定3个耐药相关细胞亚群,成果发表于SCI期刊。
  • 开发变异注释脚本,将人工审核工作量减少60%,被课题组沿用至今。
项目经验
肿瘤队列全基因组变异图谱构建
2021年3月 - 2023年8月
项目负责人
  • 主导1000例肿瘤样本WGS数据分析,建立变异数据库,支撑2篇SCI论文。
  • 设计自动化质控与注释流程,分析效率提升3倍,错误率下降至1%以下。
语言能力
英语(CET-6)可熟练阅读英文文献并撰写英文论文
证书与认证
生物信息分析师认证 - 中国生物信息学会
2021年6月

证明生物信息数据分析能力。

临床基因扩增检验技术人员上岗证 - 国家卫生健康委
2019年12月

证明临床基因检测技术能力。

其他信息
到岗时间:

可接受出差,一个月内到岗。

论文成果:

可提供代表性论文与专利清单。

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