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生物信息工程师

个人简历

熊帅帅

生物信息工程师
phone138 0013 8000
city上海
gender男
birth1995年6月
job_status在职-考虑机会
intended_city上海
max_salary20-28K
头像
个人总结

5年肿瘤与单细胞方向生物信息分析经验,主导NGS全流程流程搭建与多组学数据挖掘,熟练使用Python、R及Linux集群。累计支撑10余个临床与科研项目,产出SCI论文3篇、软著1项,擅长将分析结果转化为可落地的业务与科研结论。

工作经历
上海吉凯基因医学科技股份有限公司
基因测序生物医药
上海
生物信息工程师
单细胞分析流程开发
2022年9月 - 至今
  • 负责单细胞转录组与空间转录组分析流程搭建,将单样本分析周期由5天压缩至2天,年支撑项目量提升约60%。
  • 主导肿瘤免疫微环境分析模块开发,沉淀标准化分析脚本30余个,团队复用率超80%。
  • 对接临床与科研客户需求,累计交付项目40余个,客户满意度保持在95%以上。
上海美吉生物医药科技有限公司
NGS服务科研服务
上海
生物信息分析工程师
转录组分析Linux
2020年7月 - 2022年8月
  • 承担转录组与微生物多样性项目的标准分析,月均完成项目25个,交付准时率98%。
  • 优化比对与定量环节参数,使RNA-seq分析整体耗时缩短约30%。
  • 参与自动化报告系统建设,将报告生成人工投入减少约一半。
项目经验
肿瘤单细胞免疫微环境图谱构建 - 生物信息负责人
2024年3月 - 2024年5月
  • 基于10x单细胞数据完成质控、聚类与细胞注释,识别出5类关键免疫细胞亚群。
  • 整合bulk RNA-seq与临床随访数据,筛选出3个预后相关标志基因,模型C-index达0.72。
  • 相关成果支撑合作方发表SCI论文1篇,影响因子6.8。
多组学分析自动化流程平台 - 核心开发
2022年12月 - 2023年2月
  • 使用Nextflow与Docker封装RNA-seq、WES分析流程,实现一键式运行与结果可复现。
  • 流程上线后单项目人工操作时间由8小时降至1小时,已在团队内全面推广。
教育背景
复旦大学生命科学学院
985双一流
上海
生物信息学 硕士
2019年8月 - 2021年5月

研究方向为肿瘤基因组学;相关课程:统计遗传学、机器学习、高通量数据分析。

华中农业大学生命科学技术学院
211双一流
武汉
生物技术 本科
2016年8月 - 2020年5月

专业排名前15%,CET-6。

技能
Python(生信分析、流程开发)
R(统计建模、可视化)
Linux与Shell脚本
单细胞与空间转录组分析
NGS流程搭建(Nextflow、Docker)
SQL与数据库查询
转录组与多组学数据挖掘
统计建模与机器学习
英文文献阅读与论文撰写
荣誉奖项
国家奖学金
全国大学生生命科学竞赛二等奖
证书与认证
数据库系统工程师(软考中级) - 工业和信息化部
2021年11月

证明数据库设计与数据管理能力。

阿里云ACA大数据助理工程师 - 阿里云
2022年9月

证明云上数据处理与分析基础能力。

其他信息
到岗时间:

在职,确认录用后一个月内到岗,可接受短期出差。

代码作品集:

GitHub 主页维护生信分析脚本与流程仓库,累计Star 120+。

语言能力:

CET-6,可熟练阅读英文文献并撰写英文论文。

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