生物信息工程师
生物信息工程师
单栏 · 有照片
生物信息算法工程师
教育背景
复旦大学
985211双一流
生物信息学 硕士
上海2018年9月 - 2021年6月
研究方向：基因组变异检测算法；主修统计遗传学、机器学习、高通量测序数据分析。
华中农业大学
211双一流
生物技术 本科
武汉2014年9月 - 2018年6月
主修分子生物学、生物统计学、程序设计基础。
技能
Python / R
NGS数据分析流程
变异检测与注释
机器学习建模
Linux / Shell
GATK / BWA / Samtools
单细胞分析（Seurat）
Docker / 流程编排
SQL / 数据仓库
荣誉奖项
复旦大学优秀硕士学位论文
全国大学生生物信息学竞赛二等奖
个人总结
5年生物信息算法开发经验，专注NGS数据分析与变异检测算法，熟练使用Python、R及GATK、BWA等主流流程。主导肿瘤ctDNA低频突变检测算法优化，将检出下限降至0.1%，支撑3项临床研究落地。具备从算法设计到生产化部署的完整能力。
工作经历
上海精准医学科技有限公司
上海
精准医疗基因检测
生物信息算法工程师
2022年9月 - 至今
变异检测流程开发
- 主导肿瘤ctDNA低频突变检测算法迭代，检出下限由0.5%降至0.1%，假阳性率下降35%。
- 搭建自动化分析流程，单样本分析耗时从6小时压缩至1.5小时，支撑月均2000例检测。
- 与临床团队协作完成3项回顾性研究的数据分析，相关结果支撑2篇SCI论文发表。
北京华大基因研究中心
北京
基因测序科研服务
生物信息分析工程师
2020年7月 - 2022年8月
NGS分析数据质控
- 负责全外显子组测序数据分析，累计完成超5000例样本的变异注释与质控。
- 优化注释数据库比对逻辑，注释准确率提升至98%，返工率下降40%。
项目经验
单细胞转录组细胞类型自动注释算法
2024年3月 - 2024年5月
算法负责人
- 基于公开单细胞数据集构建分类模型，细胞类型注释准确率达92%，优于基线方法8个百分点。
- 封装为可复用Python工具包并在团队内推广，分析效率提升约50%。
肿瘤早筛多组学联合建模
2022年12月 - 2023年2月
核心算法成员
- 融合cfDNA甲基化与片段组学特征构建早筛模型，验证集AUC达0.91。
- 完成特征筛选与模型可解释性分析，为后续临床验证提供依据。
研究经历
低频体细胞突变检测算法研究/研究助理
上海
生物信息学系
2020年1月 - 2020年6月
- 提出基于背景噪声建模的突变过滤策略，在模拟数据上灵敏度提升12%。
- 研究成果发表于生物信息学领域SCI期刊，本人为第一作者。
主要成就
检出下限突破
将ctDNA低频突变检出下限从0.5%降至0.1%，达到行业领先水平。
分析效率提升
自动化流程使单样本分析耗时缩短75%，支撑检测通量翻倍。
学术产出
以第一作者发表SCI论文1篇，参与发表2篇。
证书与认证
基因健康管理师（中级） - 中国医药教育协会
2023年9月
具备遗传检测结果解读与健康管理基础能力。
全国计算机等级考试二级（Python） - 教育部考试中心
2019年3月
证明程序设计基础能力。
就从这份模板开始
模板会复制到你的账户里，每一句话、每个板块和颜色都能改，改好再下载 PDF。