生物信息工程师
生物信息工程师
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生物信息分析工程师
个人总结
4年生物信息分析经验，专注肿瘤与病原微生物二代测序数据分析，熟练使用Python、R及Linux流程开发。主导搭建WES与宏基因组分析流程，单样本分析周期缩短40%，累计支撑3万例样本交付。具备临床与科研双场景经验，能独立完成从数据质控到报告解读的全流程。
工作经历
上海吉因生物科技有限公司
上海
基因检测高新技术企业
生物信息分析工程师
2022年3月 - 至今
NGS分析流程开发
- 负责肿瘤WES与靶向Panel分析流程开发与维护，年支撑样本超1.2万例，交付准时率提升至98%。
- 优化变异注释与过滤策略，将假阳性率降低约15%，显著提升临床报告一致性。
- 编写流程文档并培训3名初级分析员，使团队独立处理常规样本周期缩短30%。
武汉华大医学检验所有限公司
武汉
医学检验测序服务
生物信息分析工程师
2021年7月 - 2022年2月
宏基因组数据分析
- 承担病原宏基因组（mNGS）样本分析，累计完成8000余例，报告平均出具时间缩短至24小时内。
- 参与搭建16S扩增子分析流程，实现从原始数据到物种注释的自动化，人工干预减少50%。
项目经验
肿瘤WES分析流程自动化升级
2023年4月 - 2024年1月
项目负责人
- 基于Nextflow重构分析流程，实现质控、比对、变异检测与注释全自动串联，单样本耗时由8小时降至4.8小时。
- 引入容器化部署与版本管理，流程复现率提升至100%，支撑跨部门协作交付。
病原mNGS报告解读辅助系统
2022年6月 - 2022年12月
核心开发
- 开发基于Python的物种丰度筛选与耐药基因匹配脚本，辅助报告解读效率提升约35%。
- 建立阳性阈值规则库，减少人工复核工作量，误判率下降约10%。
研究经历
肿瘤免疫治疗响应预测模型研究/研究助理
武汉
生物信息学实验室
2019年9月 - 2021年6月
- 构建肿瘤突变负荷与免疫治疗响应的机器学习预测模型，AUC达0.78。
- 完成公共数据库数据清洗与特征工程，成果发表于SCI期刊。
主要成就
流程效率提升
主导WES流程自动化改造，单样本分析周期缩短40%，年节省人力约600工时。
质量指标改善
优化变异过滤策略，临床报告假阳性率下降15%，客户复核投诉减少约20%。
学术产出
以第一作者发表SCI论文1篇，参与完成2项生信分析相关软件著作权。
证书与认证
生物信息数据分析师（中级） - 中国生物信息学会（筹）
2023年6月
证明生物信息数据管理与分析能力。
阿里云云计算工程师认证（ACP） - 阿里云
2022年9月
证明云计算平台与生信流程部署能力。
教育背景
华中农业大学
211双一流
生物信息学 硕士
武汉2018年9月 - 2021年6月
研究方向：肿瘤基因组变异注释与机器学习建模；以第一作者发表SCI论文1篇。
湖北大学
省属重点双一流
生物技术 本科
武汉2014年9月 - 2018年6月
相关课程：分子生物学、遗传学、统计学、程序设计基础。
技能
Python（生信分析）
R语言（统计与可视化）
Linux与Shell流程开发
GATK / BWA / Samtools
宏基因组与16S分析
单细胞转录组分析
荣誉奖项
研究生国家奖学金
全国大学生生命科学竞赛二等奖
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