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生物信息研发工程师

个人简历

熊帅帅

生物信息研发工程师
phone138 0013 8000
city上海
gender男
job_status在职-考虑机会
intended_city上海
max_salary25-35K
个人总结

生物信息学硕士,6年肿瘤与单细胞测序数据分析经验,熟练使用Python/R搭建自动化分析流程。主导开发单细胞与WES分析管线,将报告周期从5天缩短至2天,支撑年样本量超3000例。具备生信算法开发、数据库建设与临床检测产品落地经验,能独立完成从需求到交付的全流程。

教育背景
复旦大学
985211
上海
生物信息学 硕士
2016年9月 - 2019年6月

研究方向:肿瘤基因组学与单细胞转录组分析;GPA 3.8/4.0。

技能
Python(生物信息分析)
R(统计与可视化)
Linux/Shell
单细胞分析(Seurat/Scanpy)
WES/RNA-seq分析流程
数据库与流程开发(Nextflow/Docker)
工作经历
上海世和基因生物技术有限公司
基因检测精准医疗
上海
生物信息研发工程师
WES分析流程开发
2022年9月 - 至今
  • 负责肿瘤WES与RNA-seq分析流程开发与优化,将单样本分析时间由8小时压缩至3小时,支撑年检测样本量超3000例。
  • 主导单细胞转录组分析平台搭建,完成10余个临床科研项目的数据挖掘与报告输出,客户满意度达95%。
  • 搭建自动化质控与报告生成系统,使报告出错率下降40%,每月节省人工复核约60小时。
上海伯豪生物技术有限公司
科研服务高通量测序
上海
生物信息分析工程师
转录组分析16S分析
2020年7月 - 2022年8月
  • 负责转录组与微生物多样性项目的标准化分析,累计完成200余个项目交付,按期交付率100%。
  • 优化16S扩增子分析流程,将数据处理效率提升30%,并编写标准化SOP文档10余份。
项目经验
单细胞转录组分析流程开发 - 项目负责人
2022年1月 - 2022年12月
  • 基于Seurat与Scanpy开发标准化单细胞分析流程,集成质控、聚类、注释与差异分析模块,使分析效率提升50%。
  • 流程上线后支撑15个科研项目,帮助团队缩短项目周期约7天,并形成公司内部培训材料。
肿瘤突变负荷(TMB)计算与报告自动化 - 核心开发
2021年6月 - 2021年12月
  • 开发TMB自动化计算与报告生成脚本,替代人工整理,将报告生成时间从4小时缩短至30分钟。
  • 累计处理超1000例样本,结果与人工复核一致率99%,显著降低出错风险。
证书与认证
基因健康管理师(中级) - 中国医药教育协会
2022年3月

证明基因检测与健康管理相关专业能力。

全国计算机等级考试三级(数据库技术) - 教育部考试中心
2018年9月

证明数据库设计与应用能力。

荣誉奖项
复旦大学优秀毕业生
上海市生物信息学会青年优秀论文奖

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